Sirius hade tagit ledningen med 1–0 genom Melker Heier när det som såg ut som att kvitteringen kom.
Efter en hemmahörna knoppade Neffati bollen i mål, åtminstone av tv-repriserna att döma.
Men precis innanför mållinjen skickade Siriuskaptenen Henrik Castegren ut bollen ur målet.
Domaren Granit Maqedonci signalerade inte för mål till hemmaspelarnas protester.
– Den är inne, inget snack om saken, säger Neffati som jublade över mål direkt.
När han får se reprisen i Max-sändningen blir han än mer säker.
Med ett drömmål stängde i stället Leo Walta matchen i 77:e minuten. Siriusspelaren drog till på volley direkt på en hörna och säkrade de tre poängen.
Sirius har blivit något av en mardrömsmotståndare för IFK Norrköping som inte har vunnit en hemmamatch mot Uppsalalaget sedan 2018.
Norrköping ligger tolva med tre poäng ned till kvalplats och fem poäng till nedflyttningsstrecket.
Nästa match hemma mot IFK Göteborg, precis som Norrköping på 27 poäng, blir en nyckelmatch i bottenstriden.
Sirius klättrade upp på åttonde plats med 37 poäng.